Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN6P56747 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLDN6P56747 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN6P56747 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN6P56747 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms