Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP1P56715 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP1P56715 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RP1P56715 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RP1P56715 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RP1P56715 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RP1P56715 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RP1P56715 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1P56715 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1P56715 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RP1P56715 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RP1P56715 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RP1P56715 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RP1P56715 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1P56715 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1P56715 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1P56715 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1P56715 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1P56715 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1P56715 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RP1P56715 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RP1P56715 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RP1P56715 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RP1P56715 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RP1P56715 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RP1P56715 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RP1P56715 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RP1P56715 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RP1P56715 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RP1P56715 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RP1P56715 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RP1P56715 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RP1P56715 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RP1P56715 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RP1P56715 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RP1P56715 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RP1P56715 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RP1P56715 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RP1P56715 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RP1P56715 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RP1P56715 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RP1P56715 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RP1P56715 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RP1P56715 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RP1P56715 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RP1P56715 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RP1P56715 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RP1P56715 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RP1P56715 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RP1P56715 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RP1P56715 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RP1P56715 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RP1P56715 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RP1P56715 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RP1P56715 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RP1P56715 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RP1P56715 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RP1P56715 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RP1P56715 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RP1P56715 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RP1P56715 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
RP1P56715 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RP1P56715 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RP1P56715 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RP1P56715 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RP1P56715 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RP1P56715 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RP1P56715 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RP1P56715 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RP1P56715 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RP1P56715 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RP1P56715 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RP1P56715 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RP1P56715 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RP1P56715 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RP1P56715 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RP1P56715 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RP1P56715 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RP1P56715 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RP1P56715 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RP1P56715 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RP1P56715 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RP1P56715 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RP1P56715 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms