Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
WNT3AP56704 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
WNT3AP56704 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
WNT3AP56704 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
WNT3AP56704 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.2 ms