Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
BRPF1P55201 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
BRPF1P55201 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
BRPF1P55201 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
BRPF1P55201 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
BRPF1P55201 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
BRPF1P55201 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms