Protein–RNA interactions for Protein: P55157

MTTP, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTTPP55157 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTTPP55157 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTTPP55157 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTTPP55157 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTTPP55157 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTTPP55157 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MTTPP55157 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTTPP55157 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTTPP55157 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTTPP55157 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MTTPP55157 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTTPP55157 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MTTPP55157 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTTPP55157 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTTPP55157 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MTTPP55157 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTTPP55157 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTTPP55157 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTTPP55157 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTTPP55157 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MTTPP55157 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTTPP55157 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTTPP55157 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTTPP55157 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MTTPP55157 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTTPP55157 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MTTPP55157 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTTPP55157 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTTPP55157 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MTTPP55157 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTTPP55157 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTTPP55157 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTTPP55157 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTTPP55157 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MTTPP55157 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTTPP55157 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTTPP55157 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTTPP55157 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTTPP55157 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MTTPP55157 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTTPP55157 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTTPP55157 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTTPP55157 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTTPP55157 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTTPP55157 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTTPP55157 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTTPP55157 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTTPP55157 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTTPP55157 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTTPP55157 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTTPP55157 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTTPP55157 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTTPP55157 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTTPP55157 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTTPP55157 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTTPP55157 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTTPP55157 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTTPP55157 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTTPP55157 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTTPP55157 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTTPP55157 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MTTPP55157 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTTPP55157 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTTPP55157 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTTPP55157 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTTPP55157 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTTPP55157 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTTPP55157 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTTPP55157 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTTPP55157 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTTPP55157 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTTPP55157 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTTPP55157 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTTPP55157 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTTPP55157 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MTTPP55157 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTTPP55157 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms