Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HADHBP55084 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HADHBP55084 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HADHBP55084 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
HADHBP55084 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HADHBP55084 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HADHBP55084 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HADHBP55084 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HADHBP55084 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HADHBP55084 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HADHBP55084 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HADHBP55084 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HADHBP55084 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HADHBP55084 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HADHBP55084 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HADHBP55084 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HADHBP55084 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HADHBP55084 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HADHBP55084 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HADHBP55084 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HADHBP55084 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HADHBP55084 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HADHBP55084 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HADHBP55084 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HADHBP55084 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HADHBP55084 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HADHBP55084 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HADHBP55084 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HADHBP55084 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HADHBP55084 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HADHBP55084 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HADHBP55084 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HADHBP55084 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HADHBP55084 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HADHBP55084 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HADHBP55084 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HADHBP55084 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HADHBP55084 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HADHBP55084 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
HADHBP55084 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HADHBP55084 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HADHBP55084 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HADHBP55084 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HADHBP55084 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HADHBP55084 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HADHBP55084 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HADHBP55084 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HADHBP55084 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HADHBP55084 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HADHBP55084 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HADHBP55084 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HADHBP55084 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HADHBP55084 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HADHBP55084 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HADHBP55084 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HADHBP55084 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HADHBP55084 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HADHBP55084 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HADHBP55084 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
HADHBP55084 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HADHBP55084 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HADHBP55084 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HADHBP55084 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HADHBP55084 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HADHBP55084 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HADHBP55084 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HADHBP55084 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HADHBP55084 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HADHBP55084 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HADHBP55084 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HADHBP55084 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms