Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHA4P54764 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA4P54764 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA4P54764 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPHA4P54764 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPHA4P54764 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms