Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RAD23AP54725 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAD23AP54725 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RAD23AP54725 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD23AP54725 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms