Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LIMK1P53667 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LIMK1P53667 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LIMK1P53667 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms