Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NUBP1P53384 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUBP1P53384 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUBP1P53384 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUBP1P53384 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms