Protein–RNA interactions for Protein: P53041

PPP5C, Serine/threonine-protein phosphatase 5, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP5CP53041 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PPP5CP53041 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP5CP53041 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP5CP53041 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP5CP53041 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms