Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HK3P52790 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HK3P52790 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HK3P52790 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HK3P52790 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HK3P52790 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HK3P52790 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HK3P52790 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HK3P52790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HK3P52790 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HK3P52790 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HK3P52790 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HK3P52790 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HK3P52790 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HK3P52790 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HK3P52790 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HK3P52790 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HK3P52790 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HK3P52790 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HK3P52790 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HK3P52790 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HK3P52790 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HK3P52790 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HK3P52790 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HK3P52790 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HK3P52790 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HK3P52790 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HK3P52790 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HK3P52790 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HK3P52790 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HK3P52790 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HK3P52790 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HK3P52790 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HK3P52790 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HK3P52790 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HK3P52790 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HK3P52790 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HK3P52790 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HK3P52790 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HK3P52790 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HK3P52790 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HK3P52790 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HK3P52790 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HK3P52790 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HK3P52790 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HK3P52790 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HK3P52790 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HK3P52790 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HK3P52790 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HK3P52790 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HK3P52790 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HK3P52790 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HK3P52790 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HK3P52790 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HK3P52790 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HK3P52790 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HK3P52790 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HK3P52790 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HK3P52790 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HK3P52790 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HK3P52790 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HK3P52790 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HK3P52790 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HK3P52790 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HK3P52790 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HK3P52790 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HK3P52790 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HK3P52790 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HK3P52790 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HK3P52790 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HK3P52790 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HK3P52790 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HK3P52790 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HK3P52790 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HK3P52790 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HK3P52790 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HK3P52790 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms