Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR5P51681 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR5P51681 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR5P51681 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR5P51681 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR5P51681 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR5P51681 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR5P51681 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR5P51681 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR5P51681 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR5P51681 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR5P51681 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR5P51681 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR5P51681 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR5P51681 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR5P51681 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR5P51681 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR5P51681 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR5P51681 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR5P51681 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR5P51681 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR5P51681 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR5P51681 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR5P51681 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR5P51681 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR5P51681 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR5P51681 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR5P51681 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR5P51681 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR5P51681 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR5P51681 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR5P51681 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR5P51681 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR5P51681 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CCR5P51681 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCR5P51681 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR5P51681 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR5P51681 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR5P51681 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR5P51681 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR5P51681 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR5P51681 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR5P51681 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCR5P51681 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR5P51681 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR5P51681 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR5P51681 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR5P51681 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCR5P51681 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR5P51681 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR5P51681 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR5P51681 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR5P51681 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR5P51681 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCR5P51681 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCR5P51681 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCR5P51681 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR5P51681 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR5P51681 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR5P51681 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR5P51681 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCR5P51681 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR5P51681 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR5P51681 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR5P51681 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCR5P51681 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR5P51681 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCR5P51681 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR5P51681 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR5P51681 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR5P51681 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR5P51681 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR5P51681 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCR5P51681 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR5P51681 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCR5P51681 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR5P51681 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR5P51681 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCR5P51681 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCR5P51681 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCR5P51681 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCR5P51681 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR5P51681 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR5P51681 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR5P51681 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCR5P51681 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms