Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTPAP49638 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTPAP49638 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTPAP49638 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TTPAP49638 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTPAP49638 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTPAP49638 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTPAP49638 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTPAP49638 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTPAP49638 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTPAP49638 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTPAP49638 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTPAP49638 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TTPAP49638 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTPAP49638 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTPAP49638 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTPAP49638 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTPAP49638 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TTPAP49638 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TTPAP49638 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTPAP49638 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TTPAP49638 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTPAP49638 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTPAP49638 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TTPAP49638 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTPAP49638 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TTPAP49638 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTPAP49638 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTPAP49638 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTPAP49638 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTPAP49638 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TTPAP49638 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTPAP49638 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTPAP49638 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTPAP49638 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTPAP49638 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TTPAP49638 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTPAP49638 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTPAP49638 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTPAP49638 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTPAP49638 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTPAP49638 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTPAP49638 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTPAP49638 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTPAP49638 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TTPAP49638 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTPAP49638 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTPAP49638 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTPAP49638 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTPAP49638 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTPAP49638 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTPAP49638 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTPAP49638 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTPAP49638 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTPAP49638 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTPAP49638 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTPAP49638 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTPAP49638 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTPAP49638 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTPAP49638 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTPAP49638 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTPAP49638 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTPAP49638 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
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