Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP9P49458 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP9P49458 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRP9P49458 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRP9P49458 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP9P49458 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SRP9P49458 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP9P49458 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP9P49458 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP9P49458 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP9P49458 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP9P49458 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP9P49458 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRP9P49458 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP9P49458 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP9P49458 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP9P49458 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP9P49458 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP9P49458 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRP9P49458 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP9P49458 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP9P49458 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP9P49458 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP9P49458 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SRP9P49458 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP9P49458 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP9P49458 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SRP9P49458 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRP9P49458 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP9P49458 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP9P49458 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP9P49458 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SRP9P49458 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SRP9P49458 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SRP9P49458 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SRP9P49458 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP9P49458 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP9P49458 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP9P49458 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP9P49458 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SRP9P49458 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SRP9P49458 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP9P49458 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP9P49458 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRP9P49458 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SRP9P49458 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRP9P49458 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SRP9P49458 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP9P49458 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRP9P49458 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP9P49458 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP9P49458 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP9P49458 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP9P49458 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SRP9P49458 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP9P49458 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP9P49458 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP9P49458 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP9P49458 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP9P49458 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP9P49458 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SRP9P49458 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRP9P49458 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms