Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POU3F4P49335 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F4P49335 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F4P49335 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F4P49335 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POU3F4P49335 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POU3F4P49335 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POU3F4P49335 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
POU3F4P49335 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms