Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LHX1P48742 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LHX1P48742 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX1P48742 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LHX1P48742 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LHX1P48742 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX1P48742 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX1P48742 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX1P48742 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX1P48742 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX1P48742 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX1P48742 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LHX1P48742 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX1P48742 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX1P48742 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX1P48742 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX1P48742 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX1P48742 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX1P48742 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX1P48742 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX1P48742 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX1P48742 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX1P48742 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX1P48742 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX1P48742 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX1P48742 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX1P48742 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX1P48742 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX1P48742 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX1P48742 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX1P48742 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX1P48742 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX1P48742 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX1P48742 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX1P48742 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX1P48742 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX1P48742 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX1P48742 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX1P48742 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX1P48742 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX1P48742 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX1P48742 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX1P48742 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX1P48742 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX1P48742 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX1P48742 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX1P48742 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX1P48742 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX1P48742 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX1P48742 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX1P48742 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LHX1P48742 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LHX1P48742 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX1P48742 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX1P48742 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX1P48742 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX1P48742 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX1P48742 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX1P48742 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX1P48742 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX1P48742 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX1P48742 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX1P48742 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX1P48742 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX1P48742 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX1P48742 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX1P48742 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX1P48742 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX1P48742 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX1P48742 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX1P48742 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX1P48742 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX1P48742 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LHX1P48742 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LHX1P48742 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX1P48742 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX1P48742 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX1P48742 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX1P48742 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX1P48742 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LHX1P48742 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX1P48742 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHX1P48742 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms