Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLMP48507 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLMP48507 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLMP48507 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLMP48507 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLMP48507 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLMP48507 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLMP48507 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCLMP48507 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCLMP48507 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLMP48507 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLMP48507 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLMP48507 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLMP48507 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLMP48507 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLMP48507 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLMP48507 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLMP48507 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLMP48507 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLMP48507 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCLMP48507 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCLMP48507 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GCLMP48507 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCLMP48507 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCLMP48507 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLMP48507 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLMP48507 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLMP48507 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLMP48507 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLMP48507 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLMP48507 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLMP48507 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLMP48507 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLMP48507 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLMP48507 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLMP48507 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCLMP48507 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCLMP48507 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLMP48507 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLMP48507 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLMP48507 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLMP48507 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLMP48507 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLMP48507 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLMP48507 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCLMP48507 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
GCLMP48507 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLMP48507 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLMP48507 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLMP48507 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLMP48507 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLMP48507 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLMP48507 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLMP48507 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLMP48507 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLMP48507 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLMP48507 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLMP48507 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLMP48507 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLMP48507 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLMP48507 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCLMP48507 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCLMP48507 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLMP48507 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLMP48507 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLMP48507 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLMP48507 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLMP48507 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLMP48507 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLMP48507 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GCLMP48507 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GCLMP48507 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLMP48507 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLMP48507 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLMP48507 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLMP48507 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLMP48507 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLMP48507 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GCLMP48507 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GCLMP48507 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLMP48507 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLMP48507 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GCLMP48507 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLMP48507 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLMP48507 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GCLMP48507 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms