Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCLCP48506 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCLCP48506 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GCLCP48506 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GCLCP48506 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCLCP48506 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCLCP48506 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
GCLCP48506 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GCLCP48506 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCLCP48506 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCLCP48506 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GCLCP48506 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCLCP48506 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCLCP48506 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GCLCP48506 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCLCP48506 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCLCP48506 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GCLCP48506 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCLCP48506 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCLCP48506 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GCLCP48506 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCLCP48506 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCLCP48506 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCLCP48506 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GCLCP48506 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GCLCP48506 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GCLCP48506 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GCLCP48506 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GCLCP48506 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCLCP48506 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCLCP48506 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GCLCP48506 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GCLCP48506 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GCLCP48506 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCLCP48506 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GCLCP48506 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCLCP48506 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCLCP48506 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GCLCP48506 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCLCP48506 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
GCLCP48506 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCLCP48506 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GCLCP48506 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GCLCP48506 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCLCP48506 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCLCP48506 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCLCP48506 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCLCP48506 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCLCP48506 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GCLCP48506 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCLCP48506 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCLCP48506 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GCLCP48506 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GCLCP48506 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
GCLCP48506 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GCLCP48506 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCLCP48506 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCLCP48506 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCLCP48506 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
GCLCP48506 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
GCLCP48506 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GCLCP48506 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
GCLCP48506 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
GCLCP48506 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCLCP48506 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCLCP48506 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCLCP48506 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCLCP48506 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
GCLCP48506 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GCLCP48506 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCLCP48506 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCLCP48506 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GCLCP48506 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GCLCP48506 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
GCLCP48506 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCLCP48506 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GCLCP48506 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCLCP48506 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCLCP48506 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GCLCP48506 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
GCLCP48506 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms