Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GNPDA1P46926 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GNPDA1P46926 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GNPDA1P46926 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GNPDA1P46926 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms