Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RECQLP46063 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RECQLP46063 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RECQLP46063 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RECQLP46063 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RECQLP46063 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RECQLP46063 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RECQLP46063 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RECQLP46063 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RECQLP46063 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RECQLP46063 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RECQLP46063 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RECQLP46063 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RECQLP46063 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RECQLP46063 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RECQLP46063 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RECQLP46063 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RECQLP46063 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RECQLP46063 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RECQLP46063 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RECQLP46063 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RECQLP46063 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RECQLP46063 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RECQLP46063 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RECQLP46063 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RECQLP46063 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RECQLP46063 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RECQLP46063 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RECQLP46063 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RECQLP46063 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RECQLP46063 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RECQLP46063 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RECQLP46063 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RECQLP46063 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RECQLP46063 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RECQLP46063 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RECQLP46063 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RECQLP46063 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RECQLP46063 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RECQLP46063 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RECQLP46063 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RECQLP46063 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RECQLP46063 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RECQLP46063 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RECQLP46063 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RECQLP46063 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RECQLP46063 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RECQLP46063 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RECQLP46063 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RECQLP46063 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RECQLP46063 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RECQLP46063 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RECQLP46063 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RECQLP46063 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RECQLP46063 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RECQLP46063 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RECQLP46063 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RECQLP46063 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RECQLP46063 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RECQLP46063 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RECQLP46063 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RECQLP46063 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RECQLP46063 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RECQLP46063 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RECQLP46063 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RECQLP46063 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RECQLP46063 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RECQLP46063 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RECQLP46063 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RECQLP46063 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RECQLP46063 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RECQLP46063 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RECQLP46063 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RECQLP46063 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RECQLP46063 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RECQLP46063 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RECQLP46063 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RECQLP46063 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RECQLP46063 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RECQLP46063 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RECQLP46063 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RECQLP46063 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RECQLP46063 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RECQLP46063 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RECQLP46063 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RECQLP46063 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms