Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RANBP1P43487 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RANBP1P43487 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RANBP1P43487 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RANBP1P43487 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RANBP1P43487 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms