Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRATP43155 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRATP43155 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRATP43155 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRATP43155 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRATP43155 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRATP43155 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRATP43155 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRATP43155 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRATP43155 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRATP43155 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRATP43155 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRATP43155 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRATP43155 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRATP43155 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CRATP43155 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRATP43155 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRATP43155 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRATP43155 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRATP43155 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRATP43155 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRATP43155 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRATP43155 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRATP43155 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRATP43155 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRATP43155 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRATP43155 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRATP43155 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CRATP43155 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRATP43155 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRATP43155 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRATP43155 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRATP43155 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CRATP43155 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRATP43155 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRATP43155 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRATP43155 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRATP43155 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRATP43155 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CRATP43155 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRATP43155 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRATP43155 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRATP43155 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRATP43155 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRATP43155 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRATP43155 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRATP43155 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRATP43155 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRATP43155 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRATP43155 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRATP43155 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRATP43155 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRATP43155 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRATP43155 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRATP43155 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRATP43155 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRATP43155 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRATP43155 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRATP43155 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRATP43155 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRATP43155 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRATP43155 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRATP43155 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRATP43155 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRATP43155 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRATP43155 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRATP43155 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRATP43155 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRATP43155 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRATP43155 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRATP43155 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRATP43155 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRATP43155 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRATP43155 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRATP43155 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRATP43155 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRATP43155 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRATP43155 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRATP43155 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRATP43155 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRATP43155 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRATP43155 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRATP43155 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRATP43155 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms