Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGIRP43119 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTGIRP43119 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTGIRP43119 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTGIRP43119 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTGIRP43119 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms