Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC1A1P43005 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC1A1P43005 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC1A1P43005 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC1A1P43005 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms