Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC19A1P41440 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC19A1P41440 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLC19A1P41440 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC19A1P41440 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms