Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC1P41238 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC1P41238 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APOBEC1P41238 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APOBEC1P41238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
APOBEC1P41238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms