Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTGDSP41222 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTGDSP41222 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTGDSP41222 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTGDSP41222 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms