Protein–RNA interactions for Protein: P40938

RFC3, Replication factor C subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC3P40938 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC3P40938 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC3P40938 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC3P40938 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RFC3P40938 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFC3P40938 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC3P40938 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RFC3P40938 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RFC3P40938 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RFC3P40938 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RFC3P40938 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC3P40938 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RFC3P40938 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC3P40938 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RFC3P40938 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC3P40938 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC3P40938 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC3P40938 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RFC3P40938 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC3P40938 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC3P40938 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC3P40938 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC3P40938 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC3P40938 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RFC3P40938 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC3P40938 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC3P40938 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RFC3P40938 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RFC3P40938 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC3P40938 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC3P40938 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC3P40938 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC3P40938 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC3P40938 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC3P40938 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RFC3P40938 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC3P40938 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC3P40938 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RFC3P40938 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFC3P40938 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RFC3P40938 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC3P40938 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC3P40938 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RFC3P40938 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC3P40938 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC3P40938 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC3P40938 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RFC3P40938 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC3P40938 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC3P40938 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC3P40938 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC3P40938 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC3P40938 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC3P40938 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RFC3P40938 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC3P40938 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC3P40938 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC3P40938 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RFC3P40938 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC3P40938 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RFC3P40938 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC3P40938 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC3P40938 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC3P40938 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC3P40938 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RFC3P40938 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC3P40938 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC3P40938 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC3P40938 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RFC3P40938 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RFC3P40938 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms