Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARL4AP40617 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARL4AP40617 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ARL4AP40617 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ARL4AP40617 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARL4AP40617 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms