Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FDFT1P37268 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
FDFT1P37268 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FDFT1P37268 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FDFT1P37268 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FDFT1P37268 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms