Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP62P37198 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP62P37198 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP62P37198 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NUP62P37198 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP62P37198 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP62P37198 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP62P37198 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP62P37198 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NUP62P37198 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP62P37198 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP62P37198 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP62P37198 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP62P37198 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP62P37198 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NUP62P37198 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP62P37198 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP62P37198 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP62P37198 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NUP62P37198 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP62P37198 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP62P37198 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NUP62P37198 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP62P37198 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP62P37198 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP62P37198 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP62P37198 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP62P37198 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NUP62P37198 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NUP62P37198 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NUP62P37198 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP62P37198 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP62P37198 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP62P37198 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP62P37198 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NUP62P37198 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
NUP62P37198 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP62P37198 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP62P37198 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP62P37198 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP62P37198 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP62P37198 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP62P37198 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP62P37198 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
NUP62P37198 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP62P37198 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
NUP62P37198 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP62P37198 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP62P37198 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP62P37198 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP62P37198 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP62P37198 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP62P37198 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP62P37198 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NUP62P37198 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP62P37198 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP62P37198 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP62P37198 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP62P37198 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NUP62P37198 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP62P37198 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP62P37198 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP62P37198 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP62P37198 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP62P37198 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
NUP62P37198 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP62P37198 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP62P37198 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
NUP62P37198 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP62P37198 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP62P37198 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
NUP62P37198 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NUP62P37198 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms