Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SERPINF1P36955 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SERPINF1P36955 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SERPINF1P36955 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms