Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CTNNA1P35221 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CTNNA1P35221 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CTNNA1P35221 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTNNA1P35221 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CTNNA1P35221 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms