Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX2P32243 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX2P32243 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX2P32243 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX2P32243 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX2P32243 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
OTX2P32243 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX2P32243 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX2P32243 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX2P32243 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX2P32243 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX2P32243 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX2P32243 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
OTX2P32243 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTX2P32243 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTX2P32243 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
OTX2P32243 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
OTX2P32243 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTX2P32243 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTX2P32243 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTX2P32243 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
OTX2P32243 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTX2P32243 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTX2P32243 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTX2P32243 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTX2P32243 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTX2P32243 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
OTX2P32243 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
OTX2P32243 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX2P32243 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX2P32243 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX2P32243 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
OTX2P32243 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTX2P32243 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTX2P32243 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTX2P32243 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
OTX2P32243 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTX2P32243 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTX2P32243 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTX2P32243 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTX2P32243 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
OTX2P32243 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTX2P32243 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTX2P32243 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
OTX2P32243 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
OTX2P32243 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTX2P32243 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTX2P32243 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTX2P32243 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTX2P32243 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
OTX2P32243 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTX2P32243 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTX2P32243 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTX2P32243 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTX2P32243 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
OTX2P32243 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTX2P32243 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
OTX2P32243 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTX2P32243 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTX2P32243 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
OTX2P32243 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
OTX2P32243 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTX2P32243 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTX2P32243 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTX2P32243 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
OTX2P32243 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
OTX2P32243 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
OTX2P32243 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTX2P32243 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTX2P32243 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTX2P32243 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
OTX2P32243 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
OTX2P32243 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTX2P32243 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTX2P32243 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
OTX2P32243 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTX2P32243 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTX2P32243 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
OTX2P32243 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms