Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRABP1P29762 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CRABP1P29762 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CRABP1P29762 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CRABP1P29762 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms