Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX2P28328 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX2P28328 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX2P28328 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX2P28328 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX2P28328 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PEX2P28328 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX2P28328 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX2P28328 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX2P28328 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX2P28328 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PEX2P28328 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX2P28328 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX2P28328 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX2P28328 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX2P28328 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PEX2P28328 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX2P28328 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX2P28328 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX2P28328 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PEX2P28328 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PEX2P28328 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX2P28328 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PEX2P28328 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX2P28328 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX2P28328 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX2P28328 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX2P28328 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PEX2P28328 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX2P28328 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX2P28328 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PEX2P28328 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX2P28328 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX2P28328 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PEX2P28328 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PEX2P28328 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX2P28328 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX2P28328 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX2P28328 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX2P28328 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX2P28328 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX2P28328 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PEX2P28328 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX2P28328 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX2P28328 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX2P28328 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PEX2P28328 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX2P28328 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PEX2P28328 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX2P28328 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX2P28328 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX2P28328 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX2P28328 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX2P28328 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX2P28328 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PEX2P28328 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX2P28328 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX2P28328 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PEX2P28328 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX2P28328 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX2P28328 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PEX2P28328 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX2P28328 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PEX2P28328 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX2P28328 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX2P28328 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX2P28328 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PEX2P28328 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX2P28328 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX2P28328 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PEX2P28328 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX2P28328 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX2P28328 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX2P28328 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PEX2P28328 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX2P28328 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX2P28328 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX2P28328 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PEX2P28328 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX2P28328 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PEX2P28328 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX2P28328 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX2P28328 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX2P28328 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PEX2P28328 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PEX2P28328 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms