Protein–RNA interactions for Protein: P28289

TMOD1, Tropomodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1P28289 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD1P28289 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TMOD1P28289 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TMOD1P28289 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TMOD1P28289 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TMOD1P28289 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TMOD1P28289 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms