Protein–RNA interactions for Protein: P26012

ITGB8, Integrin beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB8P26012 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ITGB8P26012 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITGB8P26012 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ITGB8P26012 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ITGB8P26012 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ITGB8P26012 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms