Protein–RNA interactions for Protein: P22223

CDH3, Cadherin-3, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH3P22223 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH3P22223 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH3P22223 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH3P22223 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH3P22223 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH3P22223 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDH3P22223 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH3P22223 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH3P22223 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH3P22223 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH3P22223 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDH3P22223 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDH3P22223 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH3P22223 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDH3P22223 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH3P22223 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDH3P22223 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH3P22223 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH3P22223 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH3P22223 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDH3P22223 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH3P22223 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH3P22223 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH3P22223 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH3P22223 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH3P22223 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDH3P22223 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH3P22223 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH3P22223 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH3P22223 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDH3P22223 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH3P22223 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH3P22223 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH3P22223 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH3P22223 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH3P22223 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDH3P22223 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDH3P22223 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH3P22223 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH3P22223 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDH3P22223 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH3P22223 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH3P22223 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH3P22223 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH3P22223 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH3P22223 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDH3P22223 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH3P22223 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH3P22223 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH3P22223 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDH3P22223 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH3P22223 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH3P22223 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH3P22223 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH3P22223 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDH3P22223 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH3P22223 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH3P22223 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH3P22223 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH3P22223 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDH3P22223 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH3P22223 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDH3P22223 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH3P22223 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH3P22223 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH3P22223 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDH3P22223 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH3P22223 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH3P22223 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH3P22223 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH3P22223 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH3P22223 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDH3P22223 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH3P22223 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH3P22223 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH3P22223 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH3P22223 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDH3P22223 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH3P22223 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH3P22223 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDH3P22223 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH3P22223 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH3P22223 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CDH3P22223 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH3P22223 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH3P22223 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH3P22223 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDH3P22223 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDH3P22223 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH3P22223 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDH3P22223 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms