Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BCKDHBP21953 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BCKDHBP21953 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BCKDHBP21953 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BCKDHBP21953 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BCKDHBP21953 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
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