Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSR1P21757 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSR1P21757 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSR1P21757 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSR1P21757 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MSR1P21757 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MSR1P21757 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSR1P21757 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSR1P21757 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSR1P21757 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MSR1P21757 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSR1P21757 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MSR1P21757 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSR1P21757 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSR1P21757 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSR1P21757 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSR1P21757 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSR1P21757 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSR1P21757 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSR1P21757 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSR1P21757 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSR1P21757 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSR1P21757 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSR1P21757 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSR1P21757 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSR1P21757 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MSR1P21757 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSR1P21757 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSR1P21757 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSR1P21757 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSR1P21757 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSR1P21757 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSR1P21757 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSR1P21757 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSR1P21757 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSR1P21757 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSR1P21757 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSR1P21757 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MSR1P21757 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSR1P21757 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSR1P21757 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSR1P21757 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSR1P21757 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSR1P21757 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSR1P21757 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSR1P21757 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSR1P21757 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSR1P21757 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MSR1P21757 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSR1P21757 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSR1P21757 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSR1P21757 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSR1P21757 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSR1P21757 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSR1P21757 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSR1P21757 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSR1P21757 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSR1P21757 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSR1P21757 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSR1P21757 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSR1P21757 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSR1P21757 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSR1P21757 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSR1P21757 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSR1P21757 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSR1P21757 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSR1P21757 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSR1P21757 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MSR1P21757 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MSR1P21757 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSR1P21757 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MSR1P21757 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms