Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EPHA1P21709 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EPHA1P21709 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EPHA1P21709 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
EPHA1P21709 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms