Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
LMNB1P20700 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
LMNB1P20700 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
LMNB1P20700 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
LMNB1P20700 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMNB1P20700 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB1P20700 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms