Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ATP2B1P20020 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
ATP2B1P20020 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
ATP2B1P20020 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATP2B1P20020 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATP2B1P20020 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms