Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKB1P19838 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKB1P19838 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKB1P19838 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKB1P19838 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.6 ms