Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATF6P18850 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF6P18850 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATF6P18850 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF6P18850 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF6P18850 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF6P18850 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF6P18850 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATF6P18850 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF6P18850 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF6P18850 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF6P18850 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF6P18850 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF6P18850 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATF6P18850 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATF6P18850 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF6P18850 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF6P18850 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATF6P18850 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF6P18850 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF6P18850 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF6P18850 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATF6P18850 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATF6P18850 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ATF6P18850 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF6P18850 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF6P18850 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATF6P18850 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATF6P18850 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF6P18850 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATF6P18850 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF6P18850 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF6P18850 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF6P18850 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF6P18850 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATF6P18850 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF6P18850 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF6P18850 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF6P18850 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF6P18850 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF6P18850 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATF6P18850 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF6P18850 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF6P18850 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF6P18850 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF6P18850 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATF6P18850 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF6P18850 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF6P18850 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATF6P18850 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF6P18850 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATF6P18850 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF6P18850 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF6P18850 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF6P18850 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF6P18850 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATF6P18850 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF6P18850 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF6P18850 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATF6P18850 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF6P18850 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF6P18850 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF6P18850 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATF6P18850 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF6P18850 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF6P18850 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF6P18850 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF6P18850 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF6P18850 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATF6P18850 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF6P18850 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATF6P18850 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF6P18850 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATF6P18850 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF6P18850 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF6P18850 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATF6P18850 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF6P18850 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF6P18850 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF6P18850 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF6P18850 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF6P18850 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF6P18850 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF6P18850 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms