Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PGAM1P18669 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PGAM1P18669 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PGAM1P18669 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PGAM1P18669 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PGAM1P18669 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms