Protein–RNA interactions for Protein: P17038

ZNF43, Zinc finger protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF43P17038 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF43P17038 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF43P17038 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF43P17038 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF43P17038 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF43P17038 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms