Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME1P15531 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME1P15531 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME1P15531 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NME1P15531 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME1P15531 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME1P15531 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NME1P15531 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME1P15531 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NME1P15531 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME1P15531 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NME1P15531 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NME1P15531 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME1P15531 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME1P15531 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NME1P15531 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
NME1P15531 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME1P15531 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME1P15531 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NME1P15531 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME1P15531 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME1P15531 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME1P15531 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NME1P15531 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME1P15531 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME1P15531 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NME1P15531 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME1P15531 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME1P15531 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME1P15531 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME1P15531 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NME1P15531 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NME1P15531 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME1P15531 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME1P15531 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME1P15531 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NME1P15531 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME1P15531 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME1P15531 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NME1P15531 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NME1P15531 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NME1P15531 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME1P15531 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME1P15531 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME1P15531 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME1P15531 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NME1P15531 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME1P15531 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME1P15531 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME1P15531 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NME1P15531 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME1P15531 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME1P15531 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NME1P15531 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME1P15531 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME1P15531 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NME1P15531 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME1P15531 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME1P15531 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NME1P15531 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME1P15531 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME1P15531 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME1P15531 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME1P15531 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME1P15531 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NME1P15531 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NME1P15531 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NME1P15531 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME1P15531 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME1P15531 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME1P15531 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME1P15531 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NME1P15531 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME1P15531 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME1P15531 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NME1P15531 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NME1P15531 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME1P15531 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME1P15531 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NME1P15531 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME1P15531 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NME1P15531 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME1P15531 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME1P15531 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NME1P15531 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NME1P15531 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NME1P15531 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME1P15531 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME1P15531 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME1P15531 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME1P15531 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NME1P15531 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME1P15531 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME1P15531 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NME1P15531 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME1P15531 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME1P15531 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME1P15531 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NME1P15531 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME1P15531 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms